Имеет ли право налоговая проводить проверку уже после подачи промежуточного ликвидационного баланса?

Здравствуйте, Наталья!

Да, действия инспекции правомерны. В соответствии с п. 11 ст. 89 НК РФ выездная налоговая проверка, осуществляемая в связи с реорганизацией или ликвидацией организации-налогоплательщика, может проводиться независимо от времени проведения и предмета предыдущей проверки. При этом проверяется период, не превышающий трех календарных лет, предшествующих году, в котором вынесено решение о проведении проверки.

В ликвидации Вам не откажут, но и саму организацию не ликвидируют до момента окончания проверки.